Characterization of the transcriptome and TCR of brain and cerebrospinal fluid infiltrated CD8+ T cells in an Alzheimer’s disease mouse model
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Alzheimer’s disease (AD) is a common form of dementia characterized by the accumulation of protein aggregates in the brain of older adults. It has been observed that CD8+ T cells, particularly CD8+ TEMRA cells, infiltrate the brain and cerebrospinal fluid (CSF) of AD patients. However, the precise role of these cells in the development and progression of AD is not well understood. In this study, we used single-cell RNA sequencing (scRNAseq) and single-cell T cell receptor sequencing (scTCRseq) to examine the CD8+ T cells in the brain and CSF of a mouse model of AD (5xFAD) and its wild-type (WT) littermate controls. The AD mice (age 40–70 weeks) used in our experiments have developed memory deficits. Our analysis revealed a significant increase in the number of CD8+ T cells in the brain and CSF of AD mice compared to WT controls (n=4, p<0.05). Furthermore, these cells displayed a distinct transcriptome profile characterized by increased expression of inflammatory pathways, compared to WT mice. Through TCR sequence analysis, we also observed significant clonal expansion of CD8+ T cells in AD mice compared to WT mice. These findings provide a starting point for further investigation into the role of infiltrating CD8+ T cells in the pathogenesis of AD in this mouse model.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».