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Enregistrement W4385686664 · doi:10.4049/jimmunol.210.supp.174.01

Identification of regulatory natural killer cells in pediatric chronic graft-versus-host disease patients

2023· article· en· W4385686664 sur OpenAlexaff
Ao Mei, Madeline Lauener, Kirk R. Schultz, Subramaniam Malarkannan

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHematopoietic stem cell transplantationImmunologyGraft-versus-host diseaseDiseaseBiologyImmune systemTranscriptomeCellNatural killer cellStem cellGeneCytotoxic T cellMedicineGene expressionIn vitroInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chronic graft-versus-host disease (cGVHD) is the leading cause of late morbidity and mortality in pediatric patients, which is caused by dynamic interferences of multiple types of immune cells, including natural killer (NK) cells. While earlier studies have indicated the potential regulatory function of NK cells restraining pathogenic cell types, the identity of unique NK cell subsets remains unknown. We performed single-cell RNA sequencing on NK cells isolated from the PBMC of patients who developed cGVHD (3 patients) or not (4 patients). Through computational analyses, we identified distinct NK cell populations and found multiple subsets of NK cells expressing unique transcriptomes in patients who received hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) compared to healthy individuals, with one of the NK cell subsets exclusively present in post-HSCT patients. Significantly different gene expression patterns were observed between the two groups of patients, including cytotoxicity-related genes elevated in cGVHD patients. By applying diverse statistical analyses, we were able to characterize these NK cell subsets, indicating their potential roles in the development or prevention of cGVHD. Our study defines novel subsets of protective NK cells during cGVHD. These findings are of high translational relevance and can contribute to the treatment of cGVHD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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