Topology of cell-free DNA from tumour cells influences its immunogenicity in macrophages and dendritic cells <i>in vitro</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Activation of DNA-sensing pathways can induce an anti-tumour immune response, but the mechanisms by which tumour-derived cell-free DNA (cfDNA) activates pro-inflammatory signaling is not well-understood. In particular, the topological features of cfDNA that contribute to DNA sensor activation in phagocytes are unknown. As such, we investigated how tumour-derived cfDNA topology influences DNA sensor activation in macrophages and dendritic cells. We treated a murine colon adenocarcinoma cell line (MC38) with chemotherapy (topotecan or staurosporine) for varying durations to induce cfDNA release. We then harvested cfDNA, separated the protected (membrane-bound) and accessible (non-membranous) fractions, and quantified nuclear and mitochondrial cfDNA abundance. The cfDNA fractions were then added to murine RAW 264.7 macrophages or bone marrow-derived dendritic cells (BMDCs), and a panel of inflammatory markers was measured by RT-qPCR. We found that accessible cfDNA from MC38 cells treated with chemotherapy for 48h increased Il6 expression in RAW 264.7, but other inflammatory markers were not elevated. Interestingly, both nuclear and mitochondrial cfDNA abundance directly correlated with Il6 expression. Surprisingly, cfDNA did not induce pro-inflammatory signalling in BMDCs. These results demonstrate that tumour-derived cfDNA immunogenicity depends on its mechanistic origins, abundance, and the immune cell type to which it is exposed. We are currently examining the impact of other cfDNA biophysical properties on macrophage activation, as well as elucidating the DNA sensing pathways responsible for inducing Il6 expression. Our findings will help uncover the role of cfDNA in mediating anti-tumour immunity. E.Z. Malkin is supported by the Frederick Banting and Charles Best Canada Graduate Scholarship (FRN: FBD-175873) through CIHR. S.V. Bratman is supported by the Gattuso-Slaight Personalized Cancer Medicine Fund at the Princess Margaret Cancer Centre and the Dr. Mariano Elia Chair in Head and Neck Cancer Research at University Health Network and the University of Toronto.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».