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Enregistrement W4385687122 · doi:10.4049/jimmunol.210.supp.239.23

Characterizing the Immune Cell Transcriptomic Response To Low-Dose Ionizing Radiation

2023· article· en· W4385687122 sur OpenAlexaffabout
Bryan Marr, Abrar Ul Haq Khan, Melinda Blimkie, Salar Pashangzadeh, E. Azzam, Holly Laakso, Seung‐Hwan Lee

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEffects of Radiation Exposure
Établissements canadiensCanadian Nuclear LaboratoriesUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIonizing radiationLow Dose RadiationTranscriptomeImmune systemIn vivoComputational biologyRadiation exposureCellMedicineBiologyNuclear medicineCancer researchBioinformaticsIrradiationImmunologyPharmacologyBiotechnologyDose–response relationshipGeneticsGenePhysicsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Low-dose exposure to ionizing radiation is increasingly common in medical, industrial, and public settings worldwide. Previous studies examining the impacts of low-dose radiation (LDR) exposure on genetic material, cellular responses, and health have been inconclusive and conflicting. The National Academy of Science, Engineering and Medicine has outlined that future LDR research should utilize single-cell omics technologies and computational workflows to define the molecular signatures of LDR exposure. In partnership with the Canadian Nuclear Laboratories (CNL), we have used single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to characterize the in-vivo immune cell response to chronic LDR. Mature adult (18 weeks-old) C57BL/6 female mice were whole-body-exposed to 60Co gamma radiation for 7 days, at dose rates of 0.06 mGy/h or 0.6 mGy/h, to achieve cumulative absorbed doses of 10 mGy (n=6) or 100 mGy (n=6), respectively. scRNA-seq of cells isolated immediately post-irradiation identified subtle candidate transcriptomic changes caused by LDR exposure in splenic and bone marrow cell populations. As the first scRNA-seq study of in-vivo LDR exposure, we reveal a more detailed description of the cellular response to LDR exposure than available in the current literature. Therefore, dissemination of these results will advance radiation biology and will be valuable for evaluating Nuclear Safety guidelines. The research is funded by the CANDU Owner’s Group and the Mitacs Accelerate program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,638
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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