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Enregistrement W4385687393 · doi:10.4049/jimmunol.210.supp.88.06

Determining mechanisms of T cell leukemogenesis using E2A−/− mice

2023· article· en· W4385687393 sur OpenAlexaff
Geoffrey Parriott, Elizabeth T. Bartom, Barbara L. Kee

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Lymphoblastic Leukemia research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTransgeneT cellLeukemiaEctopic expressionThymocyteHaematopoiesisGeneCancer researchMalignant transformationMolecular biologyImmunologyCell biologyStem cellGeneticsImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract T cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is a hematological malignancy caused by the transformation of T-lymphocytes during their development. 60% of pediatric T-ALLs have ectopic expression of Tal1, a gene that promotes leukemogenesis in part by altering the function of E2A. Consistent with this, mice with germline deletion of E2A develop T-ALL that mirrors human Tal1+ T-ALL. In this study, we used mice that delete E2A at different stages in T cell development to investigate the mechanisms causing T-ALL. Mice carrying a VavCre transgene and floxed alleles of E2A (VcKO) delete E2A early in T cell development, have reduced numbers of thymocytes prior to transformation, and develop T-ALL with an average latency of 18 weeks. Mice with an LckCre transgene (LcKO) delete E2A later than VcKO mice, have replete thymi, and rarely develop T-ALL. From this, we hypothesized that 1) E2A regulates a gene program in early T cell development that is antagonistic to transformation, or 2) Having a replete, competitive thymus suppresses transformation. Pre-leukemic VcKO thymocytes showed significantly more differentially expressed genes than LcKO thymocytes, including Notch1 and Myc, and are enriched for cancer associated pathways. To determine if the lack of competition in the VcKO thymus contributes to leukemogenesis, we reconstituted VcKO thymi by transplanting wild type bone marrow into sublethally irradiated VcKO mice. BM transplant significantly increased the number and frequency of DP thymocytes and increased leukemia latency. Together, these data suggest that intrinsic loss of E2A promotes leukemogenesis by changing the gene program of early developing thymocytes and by creating a non-competitive environment that supports transformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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