Size and site specific transcriptomic responses of blue mussel (Mytilus edulis) to acute hypoxia
Notice bibliographique
Résumé
The Prince Edward Island (PEI) mussel aquaculture industry is being challenged by climate change induced environmental stressors including hypoxic/anoxic episodes, that can impact mussel health and survival. Physiological responses of mussels to hypoxia/anoxia have been studied; however, less is known about how transcriptomic response leads to physiology. The present study examined the transcriptomic response of acute (4 h) hypoxia in blue mussels (Mytilus edulis) from two sites and size classes in PEI, Canada. Overall, major changes in whole-mussel transcriptomics associated with metabolism, cellular organelles/processes and environmental sensing were observed in the first hours of hypoxia exposure. Differences in differentially expressed transcripts were observed between each site and size, indicating that responses to acute hypoxia exposure are highly complex. A size related pattern was observed, with seed size mussels having differential expression of transcripts associated with development, muscle function, and byssal attachment compared to the adults. Adult mussels had higher HSP 90 expression, while HSPs were predominately under-expressed in seed mussels. Seed mussels had significant under-expression of several classes of byssal thread attachment transcripts, indicating a decline in the production of byssal thread or detachment, both which have negative consequences for mussel aquaculture.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».