The adenylate cyclase toxin RTX domain follows a series templated folding mechanism with implications for toxin activity
Notice bibliographique
Résumé
Folding of the Repeats-in-toxin (RTX) domain of the bacterial adenylate cyclase toxin-hemolysin (CyaA) is critical to its toxin activities and the virulence of the whooping cough agent Bordetella pertussis. The RTX domain (RD) contains five RTX blocks (RTX-i to RTX-v) and their folding is driven by the binding of calcium. However, the detailed molecular mechanism via which the folding signal transmits within the five RTX blocks remains unknown. By combining single molecule optical tweezers, protein engineering, and toxin activity assays, here we demonstrate that the folding of the RD follows a strict hierarchy, with the folding starting from its C-terminal block RTX-v and proceeding towards the N-terminal RTX-i block sequentially. Our results reveal a strict series, templated folding mechanism, where the folding signal is transmitted along the RD in a series fashion from its C terminus continuously to the N terminus. Due to the series nature of this folding signal transmission pathway, the folding of RD can be disrupted at any given RTX block, rendering the RTX blocks located N-terminally to the disruption site and the acylation region of CyaA unfolded and abolishing CyaA's toxin activities. Our results reveal key mechanistic insights into the secretion and folding process of CyaA and may open up new potential avenues towards designing new therapeutics to abolish toxin activity of CyaA and combat B. pertussis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».