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Enregistrement W4385695648 · doi:10.4049/jimmunol.210.supp.62.05

Fast and efficient isolation of human EGFR-positive cells using EasySep&[trade]

2023· article· en· W4385695648 sur OpenAlexaff
Grace F. T. Poon, Alice Liang, Manreet Chehal, Allen Eaves, Sharon A. Louis, Frann Antignano

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensTerry Fox Research InstituteStemcell Technologies
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpidermal growth factor receptorCancer researchAdenocarcinomaA549 cellCell cultureAntibodyBiologyCellLung cancerEGFR inhibitorsCancerPathologyMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Epidermal growth factor receptor (EGFR) is a cell surface receptor normally expressed on most epithelial cells and some hematopoietic cells. Mutation and overexpression of EGFR is a key driver of many human cancers, including lung, breast, as well as colorectal cancers. Circulating tumour cells (CTCs) can also express EGFR, where enrichment of EGFR+ CTCs can provide promising liquid biopsy and prognostic values. EGFR-positive cells can be difficult to isolate because they are present in many tissue types at a wide range of frequencies. We have developed a simple method to isolate human EGFR-positive cells to address this challenge. A549 human lung adenocarcinoma cells expressing EGFR were spiked into human PBMCs at defined frequencies as a model system. Starting with a single-cell suspension with 10% EGFR+ cells, the EGFR-expressing cells were labeled with an antibody complex that linked the EGFR-expressing cells to magnetic particles, then separated using an EasySep™ magnet. Using this method, EGFR+ cells were enriched from 9.9 ± 3.3% to 95.0 ± 2.8% (mean ± SD; n = 14). Protocols have been optimized for different sample sizes and different EGFR+ cell starting frequencies. EasySep™-isolated EGFR+ lung adenocarcinoma cells were viable and proliferative, with fold expansion and Ki67 expression comparable to untreated cells. EasySep™ Human EGFR Positive Selection Kit enables simple and easy isolation of EGFR-positive cells in 15 minutes, facilitating EGFR and cancer research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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