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Enregistrement W4385711723 · doi:10.7150/ijbs.85209

Therapeutic implications for localized prostate cancer by multiomics analyses of the ageing microenvironment landscape

2023· article· en· W4385711723 sur OpenAlexaff
Chengpeng Gui, Jinhuan Wei, Chengqiang Mo, Yanping Liang, Junjie Cen, Yuhang Chen, Daohu Wang, Junhang Luo

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biological Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesChina Postdoctoral Science FoundationNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésProstate cancerTumor microenvironmentIn vivoMedicineCancerCancer researchImmunotherapyOncologyComputational biologyInternal medicineBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Numerous studies have substantiated the association between aging and the progression of malignant tumors in humans, notably prostate cancer (PCa).Nevertheless, to the best of our knowledge, no studies have comprehensively elucidated the intricate characteristics of the aging microenvironment (AME) in PCa.Methods: AME regulatory patterns were determined using the NMF algorithm.Then an ageing microenvironment index (AMI) was constructed, with excellent prognostic and immunotherapy prediction ability, and its' clinical relevance was surveyed through spatial transcriptomics.Further, the drug response was analysed using the Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC), the Connectivity Map (CMap) and CellMiner database for patients with PCa.Finally, the AME was studied using in vitro and vivo experiments.Results: Three different AME regulatory patterns were identified across 813 PCa patients, associated with distinct clinical prognosis and physiological pathways.Based on the AMI, patients with PCa were divided into the high-score and low-score subsets.Higher AMI score was significantly infiltrated with more immune cells, higher rate of biochemical recurrence (BCR) and worse response to immunotherapy, antiandrogen therapy and chemotherapy in PCa.In addition, we found that the combination of bicalutamide and embelin was capable of suppressing tumor growth of PCa.Besides, as the main components of AMI, COL1A1 and BGLAP act as oncogenes and were verified via in vivo and in vitro experiments.Conclusions: AME regulation is significantly associated with the diversity and complexity of TME.Quantitative evaluation of the AME regulatory patterns may provide promising novel molecular markers for individualised therapy in PCa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,151
Tête enseignante GPT0,455
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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