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Enregistrement W4385717734 · doi:10.1016/j.gim.2023.100960

“I don’t need any more unknowns hanging over my head”: Views of patients with cancer on variants of uncertain significance and low/moderate risk results from genomic sequencing

2023· article· en· W4385717734 sur OpenAlexafffund
Salma Shickh, Chloe Mighton, Marc Clausen, Rita Kodida, Ella Adi-Wauran, Daena Hirjikaka, Suvetha Krishnapillai, Emma Reble, Jordan Sam, Nancy N. Baxter, Andreas Laupacis, Yvonne Bombard, Susan Randall Armel, Melyssa Aronson, Kenneth Bond, José‐Mario Capo‐Chichi, June Carroll, Timothy Caulfield, Tammy Clifford, Iris Cohn, Irfan A. Dhalla, Craig C. Earle, Andrea Eisen, Christine Elser, Michael F. Evans, Emily Glogowski, Tracy Graham, Elena Greenfeld, Jada G. Hamilton, Wanrudee Isaranuwatchai, Monika Kastner, Raymond H. Kim, Jordan Lerner‐Ellis, Chantal F. Morel, Michelle Mujoomdar, Abdul Noor, Kenneth Offit, Seema Panchal, Mark E. Robson, Stephen W. Scherer, Adena Scheer, Kasmintan A. Schrader, Terrence Sullivan, Kevin E. Thorpe

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineBreast cancerThematic analysisCancerPsychological interventionHypervigilanceQualitative researchInternal medicineFamily medicineOncologyPsychiatryAnxiety

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,043
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,043
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0070,005
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0070,018
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeQualitatif
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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