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Enregistrement W4385721539 · doi:10.1101/2023.08.08.552318

Molecular dissection of the soluble photosynthetic antenna from a cryptophyte alga

2023· preprint· en· W4385721539 sur OpenAlexafffund
Harry W. Rathbone, Alistair J. Laos, Katharine A. Michie, Hasti Iranmanesh, Joanna Biazik, Sophia C. Goodchild, Pall Thordarson, Beverley R. Green, Paul M. G. Curmi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of New South WalesAustralian SynchrotronAustralian Nuclear Science and Technology OrganisationAustralian GovernmentAustralian Cancer Research FoundationAir Force Office of Scientific ResearchDefense Advanced Research Projects AgencyAnalytical Center for the Government of the Russian FederationAsian Office of Aerospace Research and Development
Mots-clésPhycobiliproteinPhycobilisomePhotosystemPhotosynthesisAntenna (radio)BiologyBotanyCyanobacteriaPhotosystem IIComputer scienceGeneticsTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cryptophyte algae have a unique phycobiliprotein light-harvesting antenna that fills a spectral gap in chlorophyll absorption, however, it is unclear how it transfers energy efficiently to photosystems. We show that the cryptophyte Hemiselmis andersenii expresses an energetically complex antenna comprising three distinct spectrotypes of phycobiliprotein with different quaternary structures arising from a diverse α subunit family. The bulk of the antenna consists of open quaternary form phycobiliproteins acting as primary photon acceptors, supplemented by novel open-braced forms. The final components are closed forms with a long wavelength spectral feature due to substitution of a single chromophore. We propose that the macromolecular organization of the cryptophyte antennas consists of bulk open and open-braced forms that transfer excitations to photosystems via this bridging closed form phycobiliprotein. One-Sentence Summary Algae generate a rainbow of antenna proteins by combining a conserved subunit with different members of a multigene family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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