Stress granules: stress-induced cytoplasmic mRNPs compartments linked to mRNA translational regulatory pathways
Notice bibliographique
Résumé
Stress granules (SG) are macro-complexes that assemble as phase-separated and dynamic RNA biocondensates in the cytoplasm of the eukaryotic cell when the initiation step of the general translation of mRNAs is stalled. This occurs mainly as an adaptive cell response to either environmental (i.e., radiation, exposure to chemical drugs), pathological (i.e., viral treatment), physiological (i.e., oxygen-, amino acids-, and glucose-deprivation), or therapeutic (i.e., treatment with anti-cancer drugs) translational stress. SG also formed when translation initiation is blocked through stress-independent events including alteration of the activities of specific translation initiation factors and RNA-binding proteins. Both stress-dependent and–independent inhibition of translation initiation results in the accumulation of untranslated mRNAs, considered as integral components of SG. Consistently, in vivo assays of SG assembly combined with in vitro-based assembly of SG-like biocondensates studies support a fundamental role of the accumulation of untranslated mRNA in initiating the formation of SG, which then further promote their repression, potentially in a feed-back regulatory mechanism. The potential role of SG in actively repressing translation of associated mRNAs has been supported by a number of functional studies, establishing SG as critical regulatory sites of RNA homeostasis, in particular during stress. The view that the SG environment restricts translation of associated mRNAs was however challenged in studies showing that stress-induced translation repression can occur similarly in absence and presence of SG, leading to the emerging concept that formation of SG and translation repression are uncoupled processes. While it still a debate if mRNA recruitment to SG contributes to their translation repression, recent finding reported translation of reporter mRNAs in SG, suggesting rather an active translational role of SG. In this review, we describe the main translational signaling pathways that regulate the biology of SG, summarize current data supporting RNA as an integral functional component of SG, and then discuss evidence supporting or not the role of SG in regulating translation either negatively or positively during stress.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».