Arabidopsis Tubby domain‐containing F‐box proteins positively regulate immunity by modulating PI4Kβ protein levels
Notice bibliographique
Résumé
The Tubby domain, named after the TUBBY protein in mice, binds to phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. Arabidopsis has 11 Tubby domain-containing proteins referred to as Tubby-Like Proteins (TLPs). Of the 11 TLPs, 10 possess the N-terminal F-box domain, which can interact with SKP-like proteins and form SKP1-Cullin-F-box E3 ligase complexes. Although mice TUBBY has been extensively studied, plant TLPs' functions are scarcely detailed. In this study, we show that the Arabidopsis Tubby-like protein 6 (TLP6) and its redundant homologs, TLP1, TLP2, TLP5, and TLP10, positively regulate Arabidopsis immune responses. Furthermore, in an immunoprecipitation mass spectrometry analysis to search for ubiquitination substrates of the TLPs, we identified two redundant phosphoinositide biosynthesis enzymes, phosphatidylinositol 4-kinase β proteins (PI4Kβs), PI4Kβ1 and PI4Kβ2, as TLP interactors. Importantly, TLP6 overexpression lines fully phenocopy the phenotypes of the pi4kβ1,2 mutant, while TLP6 overexpression also leads to increased PI4Kβ2 ubiquitination and reduction in its protein level in a proteasome-dependent manner. Most significantly, TLP6 overexpression does not further enhance the autoimmunity of the pi4kβ1,2 double mutant, supporting the hypothesis that TLP6 targets the PI4Kβs for ubiquitination and degradation. Thus, our study reveals a novel mechanism where TLPs promote plant immune responses by modulating the PI4Kβs protein levels.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».