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Enregistrement W4385792553 · doi:10.1101/2023.08.09.552689

Transcriptomic sexual conflict at two evolutionary timescales revealed by experimental evolution in <i>Caenorhabditis elegans</i>

2023· preprint· en· W4385792553 sur OpenAlexafffund
Katja R. Kasimatis, John H. Willis, Christine A. Sedore, Patrick C. Phillips

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésTranscriptomeSexual selectionInseminationSelection (genetic algorithm)BiologyIntrauterine inseminationEvolutionary biologyAndrologyGeneticsMedicineComputer scienceGenePregnancyGene expressionInfertilityArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Sex-specific regulation of gene expression is the most plausible way for generating sexually differentiated phenotypes from an essentially shared genome. However, since genetic material is shared, sex-specific selection in one sex can have an indirect response in the other sex. From a gene expression perspective, this tethered response can move one sex away from their wildtype expression state and impact potentially many gene regulatory networks. Here, using experimental evolution in the model nematode Caenorhabditis elegans, we explore the coupling of direct sexual selection on males with the transcriptomic response in males and females over microevolutionary timescales to uncover the extent to which post-insemination reproductive traits share a genetic basis between the sexes. We find that differential gene expression evolved in a sex-specific manner in males, while in females indirect selection causes an evolved response. Almost all differentially expressed genes were downregulated in both evolved males and females. Moreover, 97% of significantly differentially expressed genes in males and 69% of significantly differentially expressed genes in females have wildtype female-biased expression profile. Changes in gene expression profiles were likely driven through trans -acting pathways that are shared between the sexes. We found no evidence that the core dosage compensation machinery was impacted by experimental evolution. Together these data suggest a de-feminization of the male transcriptome and masculinization of the female transcriptome driven by direct selection on male sperm competitive ability. Our results indicate that on short evolutionary timescales sexual selection can generate putative sexual conflict in expression space.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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