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Enregistrement W4385799069 · doi:10.1111/1744-7917.13256

Is there hybridization between 2 species of the same genus in sympatry?—The genetic relationships between <i>Anoplophora glabripennis</i>, <i>Anoplophora chinensis</i>, and putative hybrids

2023· article· en· W4385799069 sur OpenAlexaff
Haiwen Qin, Huachao Xu, Arnaud Capron, Ilga Porth, Mingming Cui, Melody A. Keena, Xiaofang Deng, Juan Shi, Richard C. Hamelin

Notice bibliographique

RevueInsect Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Insect Ecology and Management
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyHybridLonghorn beetleSympatryGeneticsGenomeBotanyEvolutionary biologySympatric speciationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anoplophora glabripennis (Asian longhorn beetle, ALB) and Anoplophora chinensis (Citrus longhorn beetle, CLB) are native forest pests in China; they have become important international quarantine pests. They are found using the same Salix aureo-pendula host tree of Cixi, Zhejiang province, China. On this host tree, we collected additional beetles that appeared to be morphologically intermediate between ALB and CLB. By using a stereoscope, we observed that there were several bumps on the base of the elytra, which was inconsistent with ALB, which typically has a smooth elytral base, but was more like CLB, which has numerous short tubercles on the elytral base. Given their sympatry and intermediate morphology, we hypothesized that these may represent ALB × CLB hybrids. We studied the genomic profiles for 46 samples (ALB, CLB, and putative hybrids) using genotyping-by-sequencing (GBS) providing a reduced representation of the entire genome. Employing principal component analyses on the 163 GBS-derived single nucleotide polymorphism data, we found putative hybrids tightly clustered with ALB, but genetically distinct from the CLB individuals. Therefore, our initial hybrid hypothesis was not supported by genomic data. Further, while mating experiments between adult ALB and CLB were successful in 4 separate years (2017, 2018, 2020, and 2021), and oviposition behavior was observed, no progeny was produced. Having employed population genomic analysis and biological hybridization experiments, we conclude that the putative hybrids represent newly discovered morphological variants within ALB. Our approach further confirmed the advantage of genome-wide information for Anoplophora species assignment in certain ambiguous classification cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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