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Enregistrement W4385808053 · doi:10.1503/cmaj.230249

The evolution of SARS-CoV-2 seroprevalence in Canada: a time-series study, 2020–2023

2023· article· en· W4385808053 sur OpenAlexafffundvenueabout
Tanya Murphy, Hanna Swail, Jaspreet Jain, Maureen Anderson, Philip Awadalla, L Behl, Carmen Charlton, Karen Colwill, Steven J. Drews, Anne‐Claude Gingras, Deena Hinshaw, Prabhat Jha, Jamil N. Kanji, Victoria A. Kirsh, Amanda Lang, Marc‐André Langlois, Stephen Lee, Antoine Lewin, Sheila F. O’Brien, Chantale Pambrun, Kimberly Skead, David A. Stephens, Derek R. Stein, Graham Tipples, Paul G Van Caeseele, Timothy Evans, Olivia Oxlade, Bruce Mazer, David L. Buckeridge

Notice bibliographique

RevueCanadian Medical Association Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensSaskatchewan Health
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésSeroprevalenceVaccinationMedicinePopulationPandemicImmunitySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)DemographyHerd immunityImmunologyAntibodyVirologySerologyEnvironmental healthInternal medicineDiseaseImmune systemInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: During the first year of the COVID-19 pandemic, the proportion of reported cases of COVID-19 among Canadians was under 6%. Although high vaccine coverage was achieved in Canada by fall 2021, the Omicron variant caused unprecedented numbers of infections, overwhelming testing capacity and making it difficult to quantify the trajectory of population immunity. METHODS: Using a time-series approach and data from more than 900 000 samples collected by 7 research studies collaborating with the COVID-19 Immunity Task Force (CITF), we estimated trends in SARS-CoV-2 seroprevalence owing to infection and vaccination for the Canadian population over 3 intervals: prevaccination (March to November 2020), vaccine roll-out (December 2020 to November 2021), and the arrival of the Omicron variant (December 2021 to March 2023). We also estimated seroprevalence by geographical region and age. RESULTS: By November 2021, 9.0% (95% credible interval [CrI] 7.3%-11%) of people in Canada had humoral immunity to SARS-CoV-2 from an infection. Seroprevalence increased rapidly after the arrival of the Omicron variant - by Mar. 15, 2023, 76% (95% CrI 74%-79%) of the population had detectable antibodies from infections. The rapid rise in infection-induced antibodies occurred across Canada and was most pronounced in younger age groups and in the Western provinces: Manitoba, Saskatchewan, Alberta and British Columbia. INTERPRETATION: Data up to March 2023 indicate that most people in Canada had acquired antibodies against SARS-CoV-2 through natural infection and vaccination. However, given variations in population seropositivity by age and geography, the potential for waning antibody levels, and new variants that may escape immunity, public health policy and clinical decisions should be tailored to local patterns of population immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,159

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2023
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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