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Enregistrement W4385809511 · doi:10.2166/hydro.2023.229

Predicting cyanobacteria abundance with Bayesian zero-inflated models

2023· article· en· W4385809511 sur OpenAlex
Yirao Zhang, Nicolás M. Peleato

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Hydroinformatics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSoil and Water Nutrient Dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNegative binomial distributionCount dataCyanobacteriaZero-inflated modelPoisson distributionStatisticsAbundance (ecology)MathematicsBayesian probabilityZero (linguistics)Environmental sciencePoisson regressionEcologyBiologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cyanobacterial blooms are a persistent concern to water management and treatment, with blooms potentially causing the release of toxins and degrading water quality. However, previous models have not considered the zero inflation of cyanobacteria count data. Typically, a relatively large proportion of measured count data are zeros or non-detects of cyanobacteria, representing either no cyanobacteria was present or the cell number was too low to be detected. Commonly used Poisson and negative binomial models for count data underestimate the probability of zero data, making these models less reliable. This study proposes a Bayesian approach to fit the cyanobacteria abundance data with mixture models that handle zero-inflated data. Predictor variables considered included weather and water quality measures that can easily be obtained day-to-day. The optimal model (zero-inflated negative binomial) was used to predict cyanobacteria alert levels on a separate test set. The ability to predict narrow alert levels was limited, however, 76% accuracy was achieved in predicting cyanobacteria counts above or below 1,000 cells/mL. Parameter estimates were highly variable and demonstrated that complex and uncertain factors influence cyanobacteria count predictions. The modelling approach can be applied to a wide range of environmental problems where zero-inflated data is common.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,303
Score d'incertitude au seuil0,380

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle