Detection of Venezuelan Equine Encephalitis Virus from Brain Samples of Equines with Encephalitis
Notice bibliographique
Résumé
Alphavirus species are globally distributed zoonoses primarily transmitted by arthropods. The Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV) and Eastern equine encephalitis virus (EEEV) are endemic in Costa Rica. This study aims to detect these viruses in brain samples from equines displaying nervous signs. For this purpose, four published Universal RT-PCR methods were compared. The most sensitive and specific RT-PCR method was used to test a total of 70 brain samples, including 40 from bovines and 30 from equines, all exhibiting nervous signs. In the positive cases, eight different brain regions were extracted and tested using this RT-PCR. Positive cases were confirmed through sequencing. Torii RT-PCR demonstrated the highest sensitivity and specificity for diagnosing VEEV and EEEV/Sind among the four Universal RT-PCR assays. Not all assessed brain regions showed DNA amplification. None of the bovine brains was positive, and out of the 30 equine brain samples, only four tested positive, and sequencing confirmed two of these samples as VEEV subtype IE. Torii RT-PCR successfully detected VEEV in pools of the hippocampus, spinal cord, and basal nuclei, making these brain regions suitable for diagnosing this virus. None of the samples were positive for EEEV or WEEV.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».