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Enregistrement W4385953449 · doi:10.1093/braincomms/fcad222

Lunapark deficiency leads to an autosomal recessive neurodevelopmental phenotype with a degenerative course, epilepsy and distinct brain anomalies

2023· article· en· W4385953449 sur OpenAlexaff
Andrea Accogli, Maha S. Zaki, Mohammed Al‐Owain, Mansour Y. Otaif, Adam Jackson, Emanuela Argilli, Kate Chandler, Christian G E L De Goede, Tülün Cora, Javeria Raza Alvi, Atieh Eslahi, Mahsa Sadat Asl Mohajeri, Setareh Ashtiani, P Y Billie Au, Alicia Scocchia, Kirsi Alakurtti, Alistair T. Pagnamenta, Mehran Beiraghi Toosi, Ehsan Ghayoor Karimiani, Majid Mojarrad, ‬‬Fatemeh Arab, Fahrettin Duymuş, Morris H. Scantlebury, Gözde Yeşil, Jill A. Rosenfeld, Ayberk Türkyılmaz, Safiye Güneş Sağer, Tipu Sultan, Farah Ashrafzadeh, Tatheer Zahra, Fatima Rahman, Shazia Maqbool, Mohamed S. Abdel‐Hamid, Mahmoud Y. Issa, Stéphanie Efthymiou, Peter Bauer, Giovanni Zifarelli, Vincenzo Salpietro, Zuhair N. Al‐Hassnan, Siddharth Banka, Elliot H. Sherr, Joseph G. Gleeson, Pasquale Striano, Henry Houlden, Mariasavina Severino, Reza Maroofian

Notice bibliographique

RevueBrain Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of CalgaryMcGill University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilManchester Biomedical Research CentreNational Institutes of HealthUniversity College LondonAtaxia UKGreat Ormond Street Hospital CharityNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of California, San FranciscoCancer Research UKBrain Research UKRosetrees TrustMultiple System Atrophy TrustEuropean CommissionBroad InstituteNIHR Oxford Biomedical Research CentreWellcome TrustDepartment of Health and Social CareBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilScience and Technology Development FundMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésCorpus callosumEpilepsyCerebellar hypoplasia (non-human)NeuroscienceAtrophyPathologyExome sequencingBiologyPhenotypeCerebellumMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract LNPK encodes a conserved membrane protein that stabilizes the junctions of the tubular endoplasmic reticulum network playing crucial roles in diverse biological functions. Recently, homozygous variants in LNPK were shown to cause a neurodevelopmental disorder (OMIM#618090) in four patients displaying developmental delay, epilepsy and nonspecific brain malformations including corpus callosum hypoplasia and variable impairment of cerebellum. We sought to delineate the molecular and phenotypic spectrum of LNPK-related disorder. Exome or genome sequencing was carried out in 11 families. Thorough clinical and neuroradiological evaluation was performed for all the affected individuals, including review of previously reported patients. We identified 12 distinct homozygous loss-of-function variants in 16 individuals presenting with moderate to profound developmental delay, cognitive impairment, regression, refractory epilepsy and a recognizable neuroimaging pattern consisting of corpus callosum hypoplasia and signal alterations of the forceps minor (‘ear-of-the-lynx’ sign), variably associated with substantia nigra signal alterations, mild brain atrophy, short midbrain and cerebellar hypoplasia/atrophy. In summary, we define the core phenotype of LNPK-related disorder and expand the list of neurological disorders presenting with the ‘ear-of-the-lynx’ sign suggesting a possible common underlying mechanism related to endoplasmic reticulum-phagy dysfunction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,771
Score d'incertitude au seuil0,643

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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