Editorial: Post-transcriptional regulation of viral protein expression and function
Notice bibliographique
Résumé
Editorial on the research topic Post-transcriptional regulation of viral protein expression and functionPost-transcriptional regulation includes both RNA and protein modifications, leading to the modulation of protein expression levels or protein functions.These modifications may virtually regulate every cellular process, including DNA repair, transcription, cell cycle, apoptosis, environmental stress response and immune response.The use of systems biology has discovered the extraordinary complexity and the cross-talk between different posttranscriptional modification networks (1).As obligatory intracellular pathogens, posttranscriptional modification networks are common targets for viruses, not only affecting viral protein expression or function, but also providing a fine-tuning for the viral regulation of host cell biology (2).In addition, post-transcriptional modifications during viral infections have attracted increasing interest as a potential target for the development of novel antiviral strategies.In this Research Topic, four groups of authors provide new insights into different aspects of virus-host interactions involving post-transcriptional regulation.RNA modification, or epitranscriptiomics, is one of the mechanisms for posttranscriptional regulation that is growing in interest, aided by the novel omics technologies facilitating the study of these modifications.Many chemical RNA modifications have been identified to date, playing a relevant role in multiple cellular functions and pathologic processes (3).Some of these modifications, such as N6-methyladenosine (m 6 A) are more abundantly described than others, and play different roles during viral infections (4, 5).Two of the contributions in this Research Topic expose how viruses modify cellular RNAs for their own benefit.In Cristinelli et al., the RNA methylation in human immunodeficiency virus (HIV) infected cells is analyzed.The described modifications would lead to the identification of novel virus-host interactions, and these RNA modification pathways may be shared by other viruses.In Tallo-Parra et al., tRNA modification is proposed as a novel mechanism shared by RNA viruses to modulate protein expression in their own benefit.Altogether, these works highlight that epitranscriptomic analyses during virus infections may potentially uncover novel targets of therapeutic interventions.Eukaryotic cell RNA is associated with proteins, forming ribonucleoprotein complexes (RNPs), including stress granules (SGs) and processing bodies (PBs).RNA-protein Frontiers in Virology frontiersin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,008 | 0,010 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,029 | 0,019 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».