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Enregistrement W4386000334 · doi:10.1101/2023.08.17.553675

Effect of analytical variability in estimating EEG-based functional connectivity

2023· preprint· en· W4386000334 sur OpenAlexfundno aff
Sahar Allouch, Aya Kabbara, Joan Duprez, Véronique Paban, Mohamad Khalil, Julien Modolo, Mahmoud Hassan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConseil National de la Recherche ScientifiqueCampus FranceUniversité LibanaiseCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Universitaire de la Francophonie
Mots-clésNeuroimagingElectroencephalographyConsistency (knowledge bases)Computer scienceFlexibility (engineering)Pipeline (software)Similarity (geometry)Functional connectivityArtificial intelligenceData miningPattern recognition (psychology)PsychologyStatisticsMathematicsNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The significant degree of variability and flexibility in neuroimaging analysis approaches has recently raised concerns. When running any neuroimaging study, the researcher is faced with a large number of methodological choices, often made arbitrarily. This can produce substantial variability in the results, ultimately hindering research replicability, and thus, robust conclusions. Here, we addressed the analytical variability in the EEG source connectivity pipeline and its effects on outcomes consistency. Like most neuroimaging analyses, the EEG source connectivity analysis involves the processing of high-dimensional data and is characterized by a complex workflow that leads to high analytical variability. In this study, we focused on source functional connectivity variability induced by three key factors along the analysis pipeline: 1) number of EEG electrodes, 2) inverse solution algorithms, and 3) functional connectivity metrics. Outcomes variability was assessed in terms of group-level consistency, inter-, and intra-subjects similarity, using resting-state EEG data (n = 88). As expected, our results showed that different choices related to the number of electrodes, source reconstruction algorithm, and functional connectivity measure substantially affect group-level consistency, between-, and within-subjects similarity. We believe that the significant impact of such methodological variability represents a critical issue for neuroimaging studies that should be prioritized. Highlights The significant impact of methodological variability is a recognized critical priority issue for neuroimaging studies. Analytical variability related to the number of electrodes, source reconstruction algorithm, and functional connectivity measure is a prominent issue in the EEG source connectivity analysis. Group-level consistency, between-, and within-subjects similarity are substantially affected by analytical variability in the EEG source connectivity analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,036
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,231
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,964
Score d'incertitude au seuil0,191

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0360,231
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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