A genetic variation in fucosyltransferase 8 accelerates HIV-1 disease progression indicating a role for N-glycan fucosylation
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Core fucosylation by fucosyltransferase 8 (FUT8) is an important posttranslational modification that impacts components of the immune system. Genetic variations in FUT8 can alter its function and could, therefore, play a role in the antiviral immune response and pathogenesis of HIV-1. This study analysed the effect of a single nucleotide polymorphism (SNP) in FUT8 on the clinical course of HIV-1 infection. DESIGN/METHODS: The effect of SNPs in FUT8 on untreated HIV-1 disease outcome were analysed in a cohort of 304 people with HIV-1 (PWH) using survival analysis. Flow-cytometry was used to determine the effect of SNP on T-cell activation, differentiation and exhaustion/senescence. T-cell function was determined by proliferation assay and by measuring intracellular cytokine production. The effect of the SNP on HIV-1 replication was determined by in-vitro HIV-1 infections. Sensitivity of HIV-1 produced in PBMC with or without the SNP to broadly neutralizing antibodies was determined using a TZM-bl based neutralization assay. RESULTS: Presence of the minor allele of SNP rs4131564 was associated with accelerated disease progression. The SNP had no effect on T-cell activation and T-cell differentiation in PWH. Additionally, no differences in T-cell functionality as determined by proliferation and cytokine production was observed. HIV-1 replication and neutralization sensitivity was also unaffected by the SNP in FUT8. CONCLUSION: SNP rs4131564 in FUT8 showed a major impact on HIV-1 disease course underscoring a role for N-glycan fucosylation even though no clear effect on the immune system or HIV-1 could be determined in vitro .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».