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Enregistrement W4386019943 · doi:10.7554/elife.83310

Synchronization of oscillatory growth prepares fungal hyphae for fusion

2023· article· en· W4386019943 sur OpenAlexaff
Valentin Wernet, Marius Kriegler, Vojtěch Kumpošt, Ralf Mikut, Lennart Hilbert, Rainer Fischer

Notice bibliographique

RevueeLife · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensSAIT Polytechnic
Organismes subventionnairesDeutsche ForschungsgemeinschaftHelmholtz-GemeinschaftDeutsche Bundesstiftung Umwelt
Mots-clésHyphaSynchronization (alternating current)BiologyCell biologyFusionFungal growthDevelopmental biologyBiophysicsBiological systemChemistryBotanyComputer scienceTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Communication is crucial for organismic interactions, from bacteria, to fungi, to humans. Humans may use the visual sense to monitor the environment before starting acoustic interactions. In comparison, fungi, lacking a visual system, rely on a cell-to-cell dialogue based on secreted signaling molecules to coordinate cell fusion and establish hyphal networks. Within this dialogue, hyphae alternate between sending and receiving signals. This pattern can be visualized via the putative signaling protein Soft (SofT), and the mitogen-activated protein kinase MAK-2 (MakB) which are recruited in an alternating oscillatory manner to the respective cytoplasmic membrane or nuclei of interacting hyphae. Here, we show that signal oscillations already occur in single hyphae of Arthrobotrys flagrans in the absence of potential fusion partners (cell monologue). They were in the same phase as growth oscillations. In contrast to the anti-phasic oscillations observed during the cell dialogue, SofT and MakB displayed synchronized oscillations in phase during the monologue. Once two fusion partners came into each other’s vicinity, their oscillation frequencies slowed down (entrainment phase) and transit into anti-phasic synchronization of the two cells’ oscillations with frequencies of 104±28 s and 117±19 s, respectively. Single-cell oscillations, transient entrainment, and anti-phasic oscillations were reproduced by a mathematical model where nearby hyphae can absorb and secrete a limited molecular signaling component into a shared extracellular space. We show that intracellular Ca 2+ concentrations oscillate in two approaching hyphae, and depletion of Ca 2+ from the medium affected vesicle-driven extension of the hyphal tip, abolished the cell monologue and the anti-phasic synchronization of two hyphae. Our results suggest that single hyphae engage in a ‘monologue’ that may be used for exploration of the environment and can dynamically shift their extracellular signaling systems into a ‘dialogue’ to initiate hyphal fusion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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