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Enregistrement W4386022716 · doi:10.1021/acs.jpcc.3c02979

Selective Water Transport in an Alanine-Functionalized Metal–Organic Framework: A Computational Study

2023· article· en· W4386022716 sur OpenAlexaff
Fan Li, Turan S. Erkal, Haizhao Li, Mengru Zhang, François Sicard, Gündoğ Yücesan, Gabriel Hanna, A. Özgür Yazaydın

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry C · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMetal-Organic Frameworks: Synthesis and Applications
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesLeverhulme Trust
Mots-clésMolecular dynamicsDensity functional theoryMoleculeWater transportAlanineChemistryBiomoleculeHydrogen bondChemical physicsCarboxylateMetal ions in aqueous solutionComputational chemistryIonAquaporinMaterials scienceWater flowNanotechnologyAmino acidStereochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Applications of metal–organic frameworks (MOFs) functionalized with biomolecules have primarily focused on the use of these frameworks for bioimaging, catalysis, chiral separation, nanomotors, and drug delivery. However, their use in the design of artificial water channels (AWCs) has yet to be explored. In this work, we computationally explore the performance of a zwitterionic alanine-functionalized Ni-CPO-27 MOF as an AWC. Using density functional theory (DFT) calculations and equilibrium/nonequilibrium molecular dynamics (MD) simulations, the stability, water permeability, and ion selectivity of the proposed AWC are studied. The DFT calculations predict that zwitterionic alanine binds to the coordinatively unsaturated Ni sites almost twofold stronger compared to water. Using the quantum theory of atoms in molecules, it is also found that the zwitterionic alanine molecules are further stabilized through hydrogen bonding between their carboxylate (COO – ) and amino (NH 3 + ) groups. Nonequilibrium MD simulations show that the proposed AWC possesses a high osmotic water permeability of 2.2 ± 0.3 × 10 –15 cm 3 /s/channel, which lies between that observed in aquaporin-0 and aquaporin-1 proteins, while completely excluding Na + and Cl – ions from the channel. The free energies associated with the water and ion transport show that fast water transport may be attributed to the relatively low free energy barriers for water in the channel, whereas the ion exclusion is due to large free energy barriers that the ions cannot overcome even under 100 MPa of applied pressure. By using a crystalline material, the proposed design of an amino acid-functionalized MOF-based AWC represents a departure from previously developed AWCs, which rely on the self-assembly of curated molecules in lipid bilayers or polymer matrices and are susceptible to long-term stability issues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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