MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4386028826 · doi:10.3390/metabo13080963

A Solid-Phase Microextraction—Liquid Chromatography-Mass Spectrometry Method for Analyzing Serum Lipids in Psoriatic Disease

2023· article· en· W4386028826 sur OpenAlexafffund
John Koussiouris, Nikita Looby, Vathany Kulasingam, Vinod Chandran

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoMemorial University of NewfoundlandUniversity Health Network
Organismes subventionnairesKrembil FoundationUniversity of TorontoPfizer
Mots-clésPsoriatic arthritisPsoriasisChromatographyMass spectrometrySolid-phase microextractionChemistryGas chromatography–mass spectrometryArthritisTandem mass spectrometryLiquid chromatography–mass spectrometryMedicineInternal medicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Approximately 25% of psoriasis patients have an inflammatory arthritis termed psoriatic arthritis (PsA). There is strong interest in identifying and validating biomarkers that can accurately and reliably predict conversion from psoriasis to PsA using novel technologies such as metabolomics. Lipids, in particular, are of key interest in psoriatic disease. We sought to develop a liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) method to be used in conjunction with solid-phase microextraction (SPME) for analyzing fatty acids and similar molecules. A total of 25 chromatographic methods based on published lipid studies were tested on two LC columns. As a proof of concept, serum samples from psoriatic disease patients (n = 27 psoriasis and n = 26 PsA) were processed using SPME and run on the selected LC-MS method. The method that was best for analyzing fatty acids and fatty acid-like molecules was optimized and applied to serum samples. A total of 18 tentatively annotated features classified as fatty acids and other lipid compounds were statistically significant between psoriasis and PsA groups using both multivariate and univariate approaches. The SPME-LC-MS method developed and optimized was capable of detecting fatty acids and similar lipids that may aid in differentiating psoriasis and PsA patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,195
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMetabolitesMême sujetMetabolomics and Mass Spectrometry StudiesTravaux en français237 207