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Enregistrement W4386029774 · doi:10.3390/genes14081654

Finding an Appropriate Mouse Model to Study the Impact of a Treatment for Friedreich Ataxia on the Behavioral Phenotype

2023· article· en· W4386029774 sur OpenAlexafffund
Camille Bouchard, Catherine Gérard, Solange Gni-fiene Yanyabé, Nathalie Majeau, Malek Aloui, Gabrielle Buisson, Pouiré Yaméogo, Vanessa Couture, Jacques P. Tremblay

Notice bibliographique

RevueGenes · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéAtaxia CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésFrataxinAtaxiaPhenotypeTransgeneGenetically modified mouseBiologyGeneSmall hairpin RNAMolecular biologyIron-binding proteinsGene knockoutTrinucleotide repeat expansionGeneticsGene knockdownAlleleNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Friedreich ataxia (FRDA) is a progressive neurodegenerative disease caused by a GAA repeat in the intron 1 of the frataxin gene (FXN) leading to a lower expression of the frataxin protein. The YG8sR mice are Knock-Out (KO) for their murine frataxin gene but contain a human frataxin transgene derived from an FRDA patient with 300 GAA repeats. These mice are used as a FRDA model but even with a low frataxin concentration, their phenotype is mild. We aimed to find an optimized mouse model with a phenotype comparable to the human patients to study the impact of therapy on the phenotype. We compared two mouse models: the YG8sR injected with an AAV. PHP.B coding for a shRNA targeting the human frataxin gene and the YG8-800, a new mouse model with a human transgene containing 800 GAA repeats. Both mouse models were compared to Y47R mice containing nine GAA repeats that were considered healthy mice. Behavior tests (parallel rod floor apparatus, hanging test, inverted T beam, and notched beam test) were carried out from 2 to 11 months and significant differences were noticed for both YG8sR mice injected with an anti-FXN shRNA and the YG8-800 mice compared to healthy mice. In conclusion, YG8sR mice have a slight phenotype, and injecting them with an AAV-PHP.B expressing an shRNA targeting frataxin does increase their phenotype. The YG8-800 mice have a phenotype comparable to the human ataxic phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,239
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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