Using transcriptomics to examine the physiological status of wild-caught walleye (<i>Sander vitreus</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Lake Winnipeg, Manitoba, is Canada’s second largest commercial inland freshwater fishery, and concern over collapse of the walleye fishery is growing. Molecular techniques have been increasingly used to study responses of wild organisms to environmental and anthropogenic stressors. The present study used transcriptomics to examine the physiology of wild-caught walleye ( Sander vitreus (Mitchell, 1818)) across Lake Winnipeg using non-lethal techniques. Gill transcriptomes of walleye sampled from the north and south basins of Lake Winnipeg, and the channel connecting them, exhibited distinct profiles implicating regionally specific biological responses. North basin walleye exhibited transcriptomic responses indicative of exposure to environmental stressors. Transcriptomic patterns suggested a shift to increased reliance on anaerobic metabolism and up-regulation of hypoxia-sensitive genes in north basin fish, possibly representing exposure to low-oxygen conditions. Exposure to environmental stressors may also have driven increases in gene transcripts associated with proteasomal catabolism, DNA repair, molecular chaperones, and ion regulation. North basin fish also exhibited transcriptomic patterns indicative of gill remodeling via regulation of the mTOR pathway, cytoskeleton reorganization, and fatty acid synthesis. Our results highlight the complexity of examining wild fish across environmental gradients but also the potential use of molecular techniques in elucidating organismal sensitivity to local environmental factors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».