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Enregistrement W4386047602 · doi:10.3138/jammi-2022-0014

Early diagnosis of monomicrobial <i>Clostridioides difficile</i> bacteremia in a patient without colitis

2023· article· en· W4386047602 sur OpenAlexaffvenue
Jennifer Tat, Sigmund Krajden, Samir N. Patel, Greg J. German

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensToronto Public HealthPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBacteremiaVancomycinClostridioidesMetronidazoleBlood cultureIntensive care medicineInternal medicineSurgeryAntibioticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteremia is a rare finding among Clostridioides difficile infections. We describe a case of a 67-year-old man with resected colorectal cancer with colostomy who presented with small bowel obstruction and was admitted for lysis of adhesions. On day 8 of admission, he developed leukocytosis and raised inflammatory markers with isolation of Gram-positive bacilli in several blood cultures, which was presumptively identified through blood culture pelleting and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) as C. difficile. The diagnosis was confirmed with conventional culture and reference lab identification and the patient demonstrated clinical response with parenteral then oral vancomycin that briefly worsened when therapy was switched to parenteral metronidazole and then improved once oral vancomycin was resumed. Our case was notable in that the combination of pelleting and MALDI-TOF offered early diagnosis in this patient whose positive blood cultures were suspicious for contamination and in whom there was an absence of diarrheal illness or features of colitis on abdominal imaging. Early diagnosis is critical for the timely initiation of therapy, implementation of infection prevention and control measures and in selection of appropriate therapy for antimicrobial stewardship.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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