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Enregistrement W4386092032 · doi:10.18805/ijar.b-5040

Molecular Detection and Characterization of Streptococcus suis Isolated from Pneumonic Lungs of Pigs

2023· article· en· W4386092032 sur OpenAlexaboutno aff
Sumera Yasmin, Shameem Ara Begum, Seema Rani Pegu, Sophia M. Gogoi, Ramesh Nath, Biswajit Dutta, Mridusmrita Buragohain

Notice bibliographique

RevueIndian Journal of Animal Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAssam Agricultural University
Mots-clésStreptococcus suisPasteurella multocidaMicrobiologyBiologyGlutamate dehydrogenasePneumoniaPolymerase chain reactionKlebsiella pneumoniaPathogenAmpliconBacteriaVirologyGeneVirulenceStaphylococcus aureusMedicineReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Among various diseases, respiratory disease is considered a leading cause of mortality in pigs. Streptococcus suis affects respiratory tract and causes pneumonia as an opportunistic pathogen, that impairs animal health and lowers individual and herd performance in swine. Therefore, it becomes important to have an insight of bacterial pneumonia with special reference to Streptococcus suis in pig, so that control measures could be practiced effectively. Methods: Detailed post mortem examination was carried out on 180 pigs. Bacterial isolation was carried out from 127 (70.55%) lungs samples with pneumonic lesions. Further, suspected colonies of S. suis were subjected to Polymerase Chain Reaction for detection of glutamate dehydrogenase gene. Phylogenetic analysis was carried out for the positive S. suis samples. Results: Bacteria isolated were Pasteurella multocida (34.44%), S. suis (28.89%), E. coli (16.67%), Staphylococcus spp. (14.44%), Klebsiella spp. (3.33%) and Salmonella spp. (2.22%). Out of 26 suspected S. suis colonies subjected to Polymerase Chain Reaction, 17 isolates with amplicon size 688 bp were confirmed to be positive for glutamate dehydrogenase gene. The Phylogenetic analysis of glutamate dehydrogenase gene of S. suis from pigs of Assam showed percent identity above 99% with Germany, Canada and China strain of S. suis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,523
Score d'incertitude au seuil0,264

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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