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Enregistrement W4386121287 · doi:10.3390/metabo13090972

Targeted Metabolomics Analysis of Individuals Carrying the ANGPTL8 R59W Variant

2023· article· en· W4386121287 sur OpenAlexaff
Mohamed Abu‐Farha, Shibu Joseph, Anwar Mohammad, Arshad Channanath, Ibrahim Taher, Fahd Al‐Mulla, Muhammad Mujammami, Thangavel Alphonse Thanaraj, Jehad Abubaker, Anas M. Abdel Rahman

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipid metabolism and disorders
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesDasman Diabetes Institute
Mots-clésLipid metabolismMetabolomicsLysophosphatidylcholineHomeostasisBiologyMetaboliteLipidomicsMetabolismBiochemistryCholesterolEndocrinologyInternal medicinePhosphatidylcholineBioinformaticsPhospholipidMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ANGPTL8 is recognized as a regulator of lipid metabolism through its role in inhibiting lipoprotein lipase activity. ANGPTL8 gene variants, particularly rs2278426 leading to the R59W variant in the protein, have been associated with lipid traits in various ethnicities. We aimed to use metabolomics to understand the impact of the ANGPTL8 R59W variant on metabolites in humans. We used the Biocrates-p400 kit to quantify 408 plasma metabolites in 60 adult male Arab individuals from Kuwait and identify differences in metabolite levels between individuals carrying reference genotypes and those with carrier genotypes at ANGPTL8 rs2278426. Individuals with carrier genotypes (CT+TT) compared to those carrying the reference genotype (CC) showed statistically significant differences in the following metabolites: acylcarnitine (perturbs metabolic pathways), phosphatidylcholine (supports liver function and cholesterol levels), cholesteryl ester (brings chronic inflammatory response to lipoprotein depositions in arteries), α-aminoadipic acid (modulates glucose homeostasis), histamine (regulates glucose/lipid metabolism), sarcosine (links amino acid and lipid metabolism), diacylglycerol 42:1 (regulates homeostasis of cellular lipid stores), and lysophosphatidylcholine (regulates oxidative stress and inflammatory response). Functional aspects attributed to these metabolites indicate that the ANGPTL8 R59W variant influences the concentrations of lipid- and inflammation-related metabolites. This observation further highlights the role of ANGPTL8 in lipid metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,140
Score d'incertitude au seuil0,627

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,006
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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