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Enregistrement W4386127228 · doi:10.1371/journal.pone.0290464

Is scientific evidence enough? Using expert opinion to fill gaps in data in antimicrobial resistance research

2023· article· en· W4386127228 sur OpenAlexafffund
Melanie Cousins, E. Jane Parmley, Amy L. Greer, Elena Neiterman, Irene Lambraki, Tíscar Graells, Anaïs Léger, Patrik J. G. Henriksson, Max Troell, Didier Wernli, Peter Søgaard Jørgensen, Carolee A. Carson, Shannon E. Majowicz

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of GuelphUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesInstitute of Population and Public HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungCanada First Research Excellence FundMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsJoint Programming Initiative on Antimicrobial ResistanceInstitute of Infection and ImmunityPublic Health AgencyCanadian Institutes of Health ResearchNational Science FoundationRoyal SocietyPublic Health Agency of CanadaRoyal Society of CanadaVetenskapsrådet
Mots-clésContext (archaeology)Data scienceCausal loop diagramComputer scienceKnowledge managementManagement scienceEngineeringGeographyArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Antimicrobial Resistance (AMR) is a global problem with large health and economic consequences. Current gaps in quantitative data are a major limitation for creating models intended to simulate the drivers of AMR. As an intermediate step, expert knowledge and opinion could be utilized to fill gaps in knowledge for areas of the system where quantitative data does not yet exist or are hard to quantify. Therefore, the objective of this study was to identify quantifiable data about the current state of the factors that drive AMR and the strengths and directions of relationships between the factors from statements made by a group of experts from the One Health system that drives AMR development and transmission in a European context. METHODS: This study builds upon previous work that developed a causal loop diagram of AMR using input from two workshops conducted in 2019 in Sweden with experts within the European food system context. A secondary analysis of the workshop transcripts was conducted to identify semi-quantitative data to parameterize drivers in a model of AMR. MAIN FINDINGS: Participants spoke about AMR by combining their personal experiences with professional expertise within their fields. The analysis of participants' statements provided semi-quantitative data that can help inform a future of AMR emergence and transmission based on a causal loop diagram of AMR in a Swedish One Health system context. CONCLUSION: Using transcripts of a workshop including participants with diverse expertise across the system that drives AMR, we gained invaluable insight into the past, current, and potential future states of the major drivers of AMR, particularly where quantitative data are lacking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,596
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,777
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,404
Score d'incertitude au seuil0,498

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,5960,777
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,004
Bibliométrie0,0320,014
Études des sciences et des technologies0,0070,020
Communication savante0,0270,041
Science ouverte0,0100,022
Intégrité de la recherche0,0120,013
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,378
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,028 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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