MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4386168635 · doi:10.3390/genes14091680

BRCA1 Promoter Hypermethylation in Malignant Breast Tumors and in the Histologically Normal Adjacent Tissues to the Tumors: Exploring Its Potential as a Biomarker and Its Clinical Significance in a Translational Approach

2023· article· en· W4386168635 sur OpenAlexaff
Yassire Oubaddou, Mohamed Oukabli, Salma Fenniche, Abderrahim Elktaibi, Mohamed Reda Elochi, Abderrahmane Al Bouzidi, Zineb Qmichou, Nadia Dakka, Caroline Diorio, Antje Richter, Youssef Bakri, Rabii Ameziane El Hassani

Notice bibliographique

RevueGenes · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesOCP GroupInstitut Gustave-Roussy
Mots-clésBreast cancerDNA methylationCancer researchGene silencingMethylationBiomarkerEpigeneticsCancerBiologyPromoterPathologyOncologyMedicineInternal medicineGeneGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hypermethylation status of the promoter region of the breast cancer 1 (BRCA1), a well-known tumor suppressor gene, has been extensively investigated in the last two decades as a potential biomarker for breast cancer. In this retrospective study, we investigated the prevalence of BRCA1 promoter methylation in 84 human breast tissues, and we correlated this epigenetic silencing with the clinical and histopathological parameters of breast cancer. We used methylation-specific PCR (MSP) to analyze BRCA1 promoter hypermethylation in 48 malignant breast tumors (MBTs), 15 normal adjacent tissues (NATs), and 21 benign breast lesions (BBLs). The results showed that BRCA1 promoter hypermethylation was higher in MBTs (20/48; 41.67%) and NATs (7/15; 46.67%) compared to BBLs (4/21; 19.05%). The high percentage of BRCA1 hypermethylation in the histologically normal adjacent tissues to the tumors (NATs) suggests the involvement of this epigenetic silencing as a potential biomarker of the early genomic instability in NATs surrounding the tumors. The detection of BRCA1 promoter hypermethylation in BBLs reinforces this suggestion, knowing that a non-negligible rate of benign breast lesions was reported to evolve into cancer. Moreover, our results indicated that the BRCA1 promoter hypermethylated group of MBTs exhibited higher rates of aggressive features, as indicated by the SBR III grade (14/19; 73.68%), elevated Ki67 levels (13/16; 81.25%), and Her2 receptor overexpression (5/20; 25%). Finally, we observed a concordance (60%) in BRCA1 promoter hypermethylation status between malignant breast tumors and their paired histologically normal adjacent tissues. This study highlights the role of BRCA1 promoter hypermethylation as a potential useful biomarker of aggressiveness in MBTs and as an early marker of genomic instability in both histological NATs and BBLs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,813
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenesMême sujetBRCA gene mutations in cancerTravaux en français237 207