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Enregistrement W4386170071 · doi:10.1016/j.plantsci.2023.111842

Conserved and unique functions of NIN-like proteins in nitrate sensing and signaling

2023· review· en· W4386170071 sur OpenAlexafffund
Dawei Yan, Eiji Nambara

Notice bibliographique

RevuePlant Science · 2023
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNitrateBiologyNitrogen fixationNitrogen assimilationTranscription factorComputational biologyNitrogen cycleNitrogenCell biologyGeneBiochemistryGeneticsEcologyBacteriaChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nitrogen is the most abundant element in the atmosphere and serves as the foundation block of life, including plants on earth. Unlike carbon fixation through photosynthesis, plants rely heavily on external supports to acquire nitrogen. To this end, plants have adapted various strategies such as forming mutualistic relationships with nitrogen-fixing bacteria and evolving a large regulatory network that includes multiple transporters, sensors, and transcription factors for fine-tuning nitrate sensing and signaling. Nodule Inception (NIN) and NIN-like protein (NLP) are central in this network by executing multiple functions such as initiating and regulating the nodule symbiosis for nitrogen fixation, acting as the intracellular sensor to monitor the nitrate fluctuations in the environment, and activating the transcription of nitrate-responsive genes for optimal nitrogen uptake, assimilation, and usage. The involvement of NLPs in intracellular nitrate binding and early nitrate responses highlight their pivotal role in the primary nitrate response (PNR). Genome-wide reprogramming in response to nitrate by NLP is highly transient and rapid, requiring regulation in a precise and dynamic manner. This review aims to summarize recent progress in the study of NIN/NLP for a better understanding of the molecular basis of their roles and regulations in nitrate sensing and signaling, with the hope of shedding light on increasing biological nitrogen fixation and improving nitrogen use efficiency (NUE) to minimize fertilizer input in agriculture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,275

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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