Mining Sequential Patterns with Timelines from Digital Health Data
Notice bibliographique
Résumé
Descriptive pattern mining is a useful tool in expansion of knowledge. One such area of descriptive pattern mining is that of sequential pattern mining. In sequential mining, items maintain an order of occurrence. In this paper, we present a digital health solution for mining sequential patterns from real-life healthcare data. Specifically, it is a non-trivial extension to the sequential mining algorithm PrefixSpan. Through an association of time, we find improved relevance of a pattern overall significance relative to a focal point. This is particularly useful in the medical domain, where significance of information varies depending on the time of its occurrence. For example, consider a time of being diagnosed with a disease. A condition occurring 16 years prior to the time of diagnosis provides less information than the same condition occurring 2 years prior to diagnosis. In traditional sequential mining, both conditions would equally contribute to support, despite their unequal value in describing causes of diagnosis. To resolve such issue, we provide an inclusion of two additional user-defined parameters to incorporate time within itemsets—namely, a timeline interval (describing the length of an interval, of which itemsets of different intervals are treated separately by their difference in time to a focal point), as well as a maximal window (denoting the maximal interval that disallows for any greater time difference than such interval). With timelines associated to itemsets, relevance of itemsets have improved interpretability for domain experts.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».