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Enregistrement W4386245645 · doi:10.1101/2023.08.28.555099

Cool temperature acclimation in toxigenic <i>Microcystis aeruginosa</i> PCC 7806 and its non-toxigenic mutant

2023· preprint· en· W4386245645 sur OpenAlexaff
Gwendolyn F. Stark, Robbie M. Martin, Laura E. Smith, Bofan Wei, Ferdi L. Hellweger, George S. Bullerjahn, R. Michael L. McKay, Gregory L. Boyer, Steven W. Wilhelm

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesBowling Green State UniversityNational Science Foundation
Mots-clésMicrocystis aeruginosaMicrocystinOxidative stressBiologyMutantTranscriptomeMicrobiologyReactive oxygen speciesMicrocystisAcclimatizationCyanobacteriaCell biologyBiochemistryBacteriaGene expressionGeneBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract For Microcystis aeruginosa PCC 7806, temperature decreases from 26° C to 19° C double the microcystin quota per cell during growth in continuous culture. Here we tested whether this increase in microcystin provided M. aeruginosa PCC 7806 with a fitness advantage during colder-temperature growth by comparing cell concentration, cellular physiology, and the transcriptomics-inferred metabolism to a non-toxigenic mutant strain M. aeruginosa PCC 7806 Δ mcyB . Photo-physiological data combined with transcriptomic data revealed metabolic changes in the mutant strain during growth at 19° C, which included increased electron sinks and non-photochemical quenching. Increased gene expression was observed for a glutathione-dependent peroxiredoxin during cold treatment, suggesting compensatory mechanisms to defend against reactive oxygen species are employed in the absence of microcystin in the mutant. Our observations highlight the potential selective advantages of a longer-term defensive strategy in management of oxidative stress ( i.e., making microcystin) vs the shorter-term proactive strategy of producing cellular components to actively dissipate or degrade oxidative stress agents. Importance Through comparisons of a microcystin-producing wildtype strain M. aeruginosa PCC 7806 and a non microcystin-producing mutant, M. aeruginosa PCC 7806 ΔmcyB , our observations highlight defensive (microcystin production) vs active (production of degradation enzymes and increased electron sinks) strategies for dealing with cold-temperature induced oxidative stress as well as associated physiological changes. This work increases our understanding of microcystin’s intracellular function, and the role it may play in bloom ecology. In combination with other studies, this work begins to experimentally establish a mechanistic foundation to better understand cold-to-warm seasonal transitions from toxigenic to non-toxigenic strains frequently observed in situ .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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