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Enregistrement W4386250426 · doi:10.24908/iqurcp16682

Transcriptomic Analysis of CBD-Exposed Rat Placentae Reveals Down-Regulated Angiogenic Pathways and Up-Regulated Metabolic Processes

2023· article· en· W4386250426 sur OpenAlexaffvenueabout
Alexis O. Ejeckam, Bryony V. Natale, S D Allen, Kendrick Lee, Daniel B. Hardy, David R.C. Natale

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGestational Diabetes Research and Management
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern UniversityChildren’s Health Research InstituteKingston Health Sciences CentreQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeBiologyPlacentaAngiogenesisCannabisFetusIntrauterine growth restrictionPharmacologyPregnancyAndrologyBioinformaticsGeneticsGeneMedicineGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Following nicotine, cannabis is the most used drug during pregnancy. In utero cannabis exposure is linked to adverse outcomes, including fetal growth restriction. Cannabidiol (CBD), the non-hallucinogenic constituent of cannabis, is perceived as safe for use during pregnancy by ~25% of women. While studies assessing the effects of Δ-9-THC, the other principal cannabinoid in cannabis, have been initiated, research examining the impact of CBD on pregnancy is scarce. The placenta facilitates the exchange of gas, nutrients and waste between the fetus and mother. Our group has recently identified altered placental morphology and reduced fetal growth after in utero CBD exposure in rats. However, the influence of CBD on genes, transcription factors and biological processes in the placenta has not been assessed. This study aimed to identify biological pathways in the placenta that were significantly altered by CBD-exposure and correlate the findings with previously performed histological analysis. Pregnant rats were administered a daily dose of 3 mg/kg CBD or a vehicle control from embryonic day (E) 6.5-18.5. On E19.5, placentae were harvested for transcriptomic analysis. RNA extraction, library construction and bulk RNA sequencing was performed by Genome Quebec. The top differentially expressed genes were analysed using Metascape software, revealing the most up- and down-regulated Gene Ontology (GO) biological process pathways. Down-regulated GO biological processes included tube morphogenesis, angiogenesis, and blood vessel morphogenesis, which supported the angiogenic complications identified by histology. Further, the most significantly up-regulated GO biological processes were metabolic, including peptide, glycoprotein, glycosaminoglycan, and tetrahydrofolate. This is significant, as the histological analysis identified elevated Glut3 expression in the placentae from CBD-exposed pregnancies. Elevated Glut3 in fetal growth restriction is associated with changes to metabolic pathways. Consequently, additional studies will include analysis of CBD-exposed rat trophoblast cells to establish whether metabolic changes may underlie the altered morphology identified in CBD-exposed placentae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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