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Enregistrement W4386251097 · doi:10.3390/genes14091721

Gene Polymorphisms of Epithelial Cell-Derived Alarmins and Their Effects on Protein Levels and Disease Severity in Patients with COVID-19

2023· article· en· W4386251097 sur OpenAlexafffund
Maral Ranjbar, Ruth P. Cusack, Christiane E. Whetstone, Shiraz Nawaz, Christopher Khoury, Jennifer Wattie, Lesley Wiltshire, Jennifer Le Roux, Eric Cheng, Thivya Srinathan, Terence Ho, Roma Sehmi, MyLinh Duong, Gail M. Gauvreau

Notice bibliographique

RevueGenes · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonHamilton Health SciencesPopulation Health Research InstituteMcMaster University
Organismes subventionnairesMitacsAstraZeneca Canada
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeneDisease2019-20 coronavirus outbreakSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)ImmunologyCellMedicineTranscriptomeBiologyGeneticsVirologyGene expressionInfectious disease (medical specialty)Internal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The immune response in COVID-19 is characterized by the release of alarmin cytokines, which play crucial roles in immune activation and inflammation. The interplay between these cytokines and genetic variations may influence disease severity and outcomes, while sex differences might further contribute to variations in the immune response. Methods: We measured the levels of alarmin cytokines in a cohort of COVID-19 and non-COVID-19 patients using a sensitive Meso Scale Discovery system. Additionally, we conducted an SNP analysis to identify genetic variations within the IL-33 and TSLP genes. The association between these genetic variations, cytokine production, and COVID-19 severity was examined. Results: Our findings revealed elevated levels of IL-33 and IL-25 in COVID-19-positive patients compared to COVID-19-negative patients (p < 0.05), indicating their potential as therapeutic targets for disease modulation. Moreover, a minor allele within the IL-33 gene (rs3939286) was found to be associated with a protective effect against severe COVID-19 (p < 0.05), and minor alleles of the TSLP gene (rs2289276 and rs13806933) were found to significantly reduce TSLP protein levels in serum (p < 0.05). Sex-specific effects of TSLP and IL-33 SNPs were observed, suggesting a potential influence of sex hormones and genetic variations on the regulation of cytokine production. Conclusion: The present study highlights the importance of alarmin cytokines and genetic variations in COVID-19 severity, providing valuable insights into personalized treatment approaches. Our results suggest that targeting alarmin cytokines may offer potential therapeutic benefits in managing COVID-19. Furthermore, the sex-specific effects of genetic variations emphasize the need to consider individual genetic profiles and sex differences when designing targeted interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,654

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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