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Enregistrement W4386252536 · doi:10.1101/2023.08.28.555048

The human AMPKγ3 R225W mutation does neither enhance basal AMPKγ3-associated activity nor glycogen in human or mouse skeletal muscle

2023· preprint· en· W4386252536 sur OpenAlexfundno aff
Nicolas O. Eskesen, Rasmus Kjøbsted, Jesper B. Birk, Nicolai S. Henriksen, Nicoline R. Andersen, Stine Ringholm, Henriette Pilegaard, Christian Pehmøller, Jørgen F. P. Wojtaszewski

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNovo Nordisk FondenNovo NordiskUniversity of OttawaDanmarks Frie ForskningsfondPfizer
Mots-clésAMPKSkeletal muscleGlycogenEndocrinologyInternal medicineProtein kinase AAMP-activated protein kinaseChemistryBiologyPhosphorylationCell biologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background AMP-activated protein kinase (AMPK) is activated during cellular energy perturbation. AMPK is composed of three subunits and several variants of AMPK complexes are expressed in skeletal muscle. The regulatory AMPKγ3 subunit is predominantly expressed in fast-twitch muscle fibers. A human AMPKγ3 R225W mutation has been described in two families. In cultured cells derived from R225W carrier muscle, the mutation was reported to increase total AMPK activity. In addition, elevated glycogen levels were observed in skeletal muscle. This led to the idea of AMPKγ3 being involved in glycogen levels in skeletal muscle. Evidence for such a causative link has never been provided. Results We studied newly obtained muscle biopsies from three human carriers of the AMPKγ3 R225W mutation and matched controls and we developed a novel knock-in mouse model carrying the AMPKγ3 R225W mutation (KI HOM). In all three human pairs, the basal AMPKγ3-associated activity was reduced when assayed in the absence of exogenous AMP. No difference was observed when assayed under AMP saturation, which was supported by findings in muscle of KI HOM mice. Furthermore, the well-established stimulatory effects of AICAR/muscle contraction on AMPKγ3-associated activity were absent in muscle from KI HOM mice. Muscle glycogen levels were not affected by the mutation in human carriers or in KI HOM mice. Conclusions The AMPKγ3 R225W mutation does not impact AMPK-associated activity in mature human skeletal muscle and the mutation is not linked to glycogen accumulation. The R225W mutation ablates AMPKγ3-associated activation by AICAR/muscle contractions, presumably through loss of nucleotide binding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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