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Enregistrement W4386256584 · doi:10.24908/iqurcp16748

Optimizing a Novel Fate-Mapping Strategy to Assess Tissue Resident Macrophages in Muscle Regeneration

2023· article· en· W4386256584 sur OpenAlexaffvenue
Jiarui Che, Sarah Dick

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRegeneration (biology)Skeletal muscleFate mappingProgenitor cellMuscle tissueCell biologyCX3CR1Reporter geneMonocyteImmune systemImmunologyStem cellEndocrinologyChemokineGene expressionChemokine receptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tissue resident macrophages (TRMs) are heterogenous innate immune cells involved in tissue homeostasis and repair, yet their role in muscle regeneration is currently unknown. TRMs differ from classical monocyte-derived macrophages (MDMs) in both ontogeny and function. Our inability to differentiate TRMs from MDMs has limited the development of subset specific immunotherapies. The novel Cx3cr1CreER/+:RosaTd/+ fate-mapping mouse model employs tamoxifen inducible labeling of MDMs and TRMs with a TdTomato reporter (Td) that persists only in self-renewing TRMs, while MDMs are replaced by Td- monocyte progenitors over a 4-week period. This strategy has been successfully used in adult mice heart and brain tissue. However, in the skeletal muscle, expression level of the Cx3cr1 reporter gene is unknown. We assessed muscle TRM Cx3cr1 expression in neonate (P3), young (P21), and adult (10wk) mice to optimize a pulse/chase strategy to label muscle TRMs with the Td reporter. Like heart and brain tissue, we found muscle TRMs express high levels of Cx3cr1 throughout development and adulthood suggesting viability of this strategy. We performed a single injection of tamoxifen in adult Cx3cr1CreER/+:RosaTd/+ mice and showed ~20% induction in blood monocytes and muscle TRMs. Although Td induction was poor, levels were similar between the blood and muscle, suggesting accuracy of the model. The next step is to optimize tamoxifen administration to achieve >90% labelling in blood and muscle. To assess spatial localization of TRMs with muscle resident stem cells (satellite cells) we optimized immunofluorescence staining on tissue sections. We found a statistically significant increase in colocalization of macrophages with satellite cells in healthy and injured gastrocnemius tissue, consistent with their predicted role in satellite cell proliferation. Once complete, our fate-mapping approach will allow for the labelling of muscle TRM subsets and reveal their role in the regeneration process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,202
Tête enseignante GPT0,401
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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