Characteristics of plasma exosomal RNA profile in obesity-related knee osteoarthritis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: As the most important risk factors of knee osteoarthritis (OA), obesity is closely related to the clinical symptoms and OA progression of patients. The purpose of this study was to explore the characteristics of exosomal RNAs in plasma of knee OA patients with obesity and discussed their potential diagnostic and therapeutic value in obese knee OA. Methods: The 101 participants with knee OA patients were divided into three groups according to BMI class. The corresponding clinical information was recorded and the correlation with obesity was analyzed. Next, we extracted the plasma exosomes from three OA patients with obesity (BMI≥30kg/m2) and three OA patients without obesity (BMI 18.5-24kg/m2). Then, quantitative sequencing of the whole transcriptome exosomal RNAs, including mRNAs, lncRNAs and circRNAs, was performed and the differential expression of the exosomal RNAs were analyzed. At last, the function of differential RNAs in plasma exosomes between the two groups were discussed via GO enrichment, KEGG pathways and interaction Analysis. Results: There was a negative relationship between BMI and HSS (Hospital for special surgery) score and a positive relationship between BMI and WOMAC (The Western Ontario and McMaster Universities Osteoarthritis) index in 101 participants with knee OA. There were 334 mRNAs and 29 lncRNAs showing significant differential expression between obesity OA group and non-obesity OA group, including 189 up-regulated mRNAs, 145 down-regulated mRNAs, 15 up-regulated lncRNAs and 14 down-regulated lncRNAs. Signal pathway analysis showed that metabolism-related changes including metabolism and organismal system, fatty acid metabolism, positive regulation of fatty acid oxidation, adipocytokine signaling pathway, insulin resistance were enriched in obesity-related OA group. Furthermore, 7 differentially expressed lncRNAs related to lipid metabolism process were screened out, including lnc-TAL1-3-2, NONHSAT209148.1, lnc-DLEU2, Inc00969, lnc-CABP4-2, lnc-CHD1L-5 and lnc-ERICH1-19. However, there was no differential expression of cirRNAs between two groups. Conclusion: Knee OA patients with obesity had more serious clinical symptoms and signs. Compared to the control group, there was obviously differential expression of mRNAs and lncRNAs in plasma exosomes of knee OA patients with obesity. The differential mRNAs and lncRNAs in plasma exosomes may potentially affect synovial inflammation of joint and participate in the pathological injury of OA. Our data suggested that plasma exosomal RNA may be a potential diagnostic and intervention target for OA patients with obesity in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».