Emergence of SARS-CoV-2 Delta Variant and Effect of Nonpharmaceutical Interventions, British Columbia, Canada
Notice bibliographique
Résumé
T hroughout the COVID-19 pandemic, SARS-CoV-2 variants have emerged through viral mutation.Variants demonstrating an increase in transmissibility or virulence; changes in clinical manifestations; or a decrease in the effectiveness of public health measures, diagnostics, vaccines, or therapeutics are designated variants of concern (VOCs) by the World Health Organization (1).By June 2021, a total of 4 SARS-CoV-2 variants had been designated VOCs (1).Designated a VOC in May 2021, Delta largely replaced the earlier Alpha, Beta, and Gamma VOCs because of its comparatively higher transmissibility (2).In India, where it was first detected, Delta outcompeted Alpha and drove an increase of COVID-19 cases beginning in March 2021 (3).By mid-August 2021, Delta represented >90% of genetically sequenced SARS-CoV-2 samples submitted to GISAID (https://www.gisaid.org), dominating on a global scale until its decline in favor of Omicron beginning in December 2021 (4,5).By March 1, 2021, British Columbia (2021 population 5,214,805), Canada, had reported >80,000 COVID-19 cases and detected Alpha, Beta, and Gamma VOC cases among residents (6).The Delta VOC was first detected in British Columbia during the week of March 21, 2021, but did not grow to dominance (>50% prevalence) until 17 weeks later, during the week of July 18, 2021, after major relaxations in public health measures, or nonpharmaceutical interventions (NPIs).Differences in factors such as NPIs, vaccination rates, competing variants in circulation, and population density and behavior may result in interjurisdictional differences in the transmission and growth rates of variants (7-10).The initial growth and time to dominance of Delta in British Columbia was slower than in jurisdictions such as England, Scotland, and several US states (7-10).In England, Delta grew to Emergence of SARS-CoV-2 Delta Variant and Effect of Nonpharmaceutical Interventions, British Columbia, Canada
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».