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Enregistrement W4386283754 · doi:10.3390/curroncol30090578

Helicobacter pylori Status May Differentiate Two Distinct Pathways of Gastric Adenocarcinoma Carcinogenesis

2023· article· en· W4386283754 sur OpenAlexaffvenue
Martin Tobi, Douglas Weinstein, Mijin Kim, James S. Hatfield, Paula Sochacki, Edi Levi, Teisa An, Merlın Hamre, Vasundhara Tolia, Suzanne Fligiel, Rama Marepally, Jason J. Hallman, Bharati Bapat, Mei Yuan, Benita L. McVicker, Steven Gallinger

Notice bibliographique

RevueCurrent Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensUniversity Health NetworkMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIntestinal metaplasiaProbandAdenocarcinomaCancerPhenotypeGastroenterologyInternal medicineHelicobacter pyloriPathologyMutationBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: We evaluated the phenotype of sporadic gastric cancer based on HP status and binding of a tumor risk marker monoclonal, Adnab-9. Methods: We compared a familial GC kindred with an extremely aggressive phenotype to HP-positive (HP+) and -negative (HP−) sporadic gastric adenocarcinoma (GC) patients in the same community to determine if similar phenotypes exist. This might facilitate gene discovery to understand the pathogenesis of aggressive GC phenotypes, particularly with publications implicating immune-related gene-based signatures, and the development of techniques to gauge the stance of the innate immune system (InImS), such as the FERAD ratio (blood ferritin:fecal Adnab-9 binding OD-background binding). Resection specimens for the sporadic and familial group were stained for HP and examined for intestinal metaplasia (IM) and immunostaining for Adnab-9. Familial kindred specimens were also tested for the E-cadherin mutation and APC (adenomatous polyposis coli). Survival was evaluated. Results: Of 40 GC patients, 25% were HP+ with a greater proportion of intestinal metaplasia (IM) and gastric atrophy than the HP− group. The proband of the familial GC kindred, a 32-year-old mother with fatal GC, was survived by 13-year-old identical twins. Twin #1 was HP− with IM and Twin #2 was HP+. Both twins subsequently died of GC within two years. The twins did not have APC or E-cadherin mutations. The mean overall survival in the HP+ sporadic GC group was 2.47 ± 2.58 years and was 0.57 ± 0.60 years in the HP− group (p = 0.01). Survival in the kindred was 0.22 ± 0.24 years. Adnab-9 labeling was positive in fixed tissues of 50% of non-familial GC patients and in gastric tissue extract from Twin #2. The FERAD ratio was determined separately in six prospectively followed patient groups (n = 458) and was significantly lower in the gastric cancer patients (n = 10) and patients with stomach conditions predisposing them to GC (n = 214), compared to controls (n = 234 patients at increased risk for colorectal cancer but without cancer), suggesting a failure of the InImS. Conclusion: The HP+ sporadic GC group appears to proceed through a sequence of HP infection, IM and atrophy before cancer supervenes, and the HP− phenotype appear to omit this sequence. The familial cases may represent a subset with both features, but the natural history strongly resembles that of the HP− group. Two different paths of carcinogenesis may exist locally for sporadic GC. The InImS may also be implicated in prognosis. Identifying these patients will allow for treatment stratification and early diagnosis to improve GC survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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