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Enregistrement W4386301014 · doi:10.1093/cid/ciad523

Clinical Outcomes and Management of NAAT-Positive/Toxin-Negative <i>Clostridioides difficile</i> Infection: A Systematic Review and Meta-Analysis

2023· review· en· W4386301014 sur OpenAlexaff
Connor Prosty, Ryan Hanula, Khaled Katergi, Yves Longtin, Emily G. McDonald, Todd C. Lee

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University Health CentreUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineClostridioidesClostridium difficile toxin AToxinNucleic Acid Amplification TestsConfidence intervalMeta-analysisClostridium difficileGastroenterologyMicrobiologyVirologyAntibioticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Standalone nucleic acid amplification tests (NAATs) are frequently used to diagnose Clostridioides difficile infections (CDI), although they may be unable to distinguish colonization from disease. A 2-stage algorithm pairing NAATs with toxin immunoassays (Toxin) may improve specificity. We evaluated clinical outcomes of patients who were NAAT+/Toxin+ versus NAAT+/Toxin- and treated versus untreated NAAT+/Toxin- cases through systematic review and meta-analysis. METHODS: We searched EMBASE and MEDLINE from inception to April 1, 2023 for articles comparing CDI outcomes among symptomatic patients tested by NAAT and Toxin tests. The risk differences (RD) of all-cause mortality and CDI recurrence were computed by random effects meta-analysis between patients who were NAAT+/Toxin+ and NAAT+/Toxin-, as well as between patients who were NAAT+/Toxin- and treated or untreated. RESULTS: Twenty-six observational studies comprising 12 737 patients were included. The 30-day all-cause mortality was not significantly different between those who were NAAT+/Toxin+ (8.4%) and NAAT+/Toxin- (6.7%) (RD = 0.41%, 95% confidence interval [CI] = -.67, 1.49). Recurrence at 60 days was significantly higher among patients who were NAAT+/Toxin+ (19.8%) versus NAAT+/Toxin- (11.0%) (RD = 7.65%, 95% CI = 4.60, 10.71). Among treated compared to untreated NAAT+/Toxin- cases, the all-cause 30-day mortalities were 5.0% and 12.7%, respectively (RD = -7.45%, 95% CI = -12.29, -2.60), but 60-day recurrence was not significantly different (11.6% vs 7.0%, respectively; RD = 5.25%, 95% CI -1.71, 12.22). CONCLUSIONS: Treatment of patients who were NAAT+/Toxin- was associated with reduced all-cause mortality but not recurrence. Although subject to the inherent limitations of observational studies, these results suggest that some patients who are NAAT+/Toxin- may benefit from treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,028
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,183
Tête enseignante GPT0,475
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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