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Enregistrement W4386316910 · doi:10.1002/9781119862611.ch10

Respiratory System Microbiome

2023· other· en· W4386316910 sur OpenAlexaff
Robin Saar, Sarah Dodd

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusobacteriaFirmicutesMicrobiomeBiologyBacteroidetesActinobacteriaProteobacteriaMicrobiologyPharynxRespiratory systemPhysiologyBacteriaAnatomy16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The main functions of the upper respiratory system are to act as a filter and provide heat and humidity to the air before it reaches the lungs. The upper respiratory system includes the nostrils, rhino-pharynx, oropharynx, larynx, and the middle cavity of the ear through the Eustachian tube, which represents the most diverse microbiome site with more bacterial species than the digestive tract. The mucous surfaces of these areas are colonized by a wide range of bacteria belonging to the genera Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes, Proteobacteria , and Fusobacteria in humans (Santacroce, L, Charitos, I.A., Ballini, A. et al. (2020). The human respiratory system and its microbiome at a glimpse. Biology (Basel) 9 (10): 318. 10.3390/biology9100318). Each area in this system has its own features such as humidity, temperature, relative oxygen concentration, and specific type of epithelial cells. These environmental changes result in different microbiota colonizing each area (Vientós-Plotts, A.I., Ericsson, A.C., Rindt, H. et al. (2017). Dynamic changes of the respiratory microbiota and its relationship to fecal and blood microbiota in healthy young cats. PLoS One 12 (3): e0173818. 10.1371/journal.pone.0173818). Being the initial site for the introduction of microbes through respiration and ingestion, the commensal bacteria in these areas are the first responders against pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,172

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0510,018

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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