OptoDyCE-plate as an affordable high throughput imager for all optical cardiac electrophysiology
Notice bibliographique
Résumé
We present a simple low-cost system for comprehensive functional characterization of cardiac function under spontaneous and paced conditions, in standard 96 and 384-well plates. This full-plate actuator/imager, OptoDyCE-plate, uses optogenetic stimulation and optical readouts of voltage and calcium from all wells in parallel. The system is validated with syncytia of human induced pluripotent stem cell derived cardiomyocytes, iPSC-CMs, grown as monolayers, or in quasi-3D isotropic and anisotropic constructs using electrospun matrices, in 96 and 394-well format. Genetic modifications, e.g. interference CRISPR (CRISPRi), and nine compounds of acute and chronic action were tested, including five histone deacetylase inhibitors (HDACis). Their effects on voltage and calcium were compared across growth conditions and pacing rates. We also demonstrated deployment of optogenetic cell spheroids for point pacing to study conduction in 96-well format, and the use of temporal multiplexing to register voltage and calcium simultaneously on a single camera in this stand-alone platform. Opto-DyCE-plate showed excellent performance even in the small samples in 384-well plates, in the various configurations. Anisotropic structured constructs may provide some benefits in drug testing, although drug responses were consistent across tested configurations. Differential voltage vs. calcium responses were seen for some drugs, especially for non-traditional modulators of cardiac function, e.g. HDACi, and pacing rate was a powerful modulator of drug response, highlighting the need for comprehensive multiparametric assessment, as offered by OptoDyCE-plate. Increasing throughput and speed and reducing cost of screening can help stratify potential compounds early in the drug development process and accelerate the development of safer drugs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».