Sex- versus apomictic-specific polymorphisms in the 5’UTR of APOLLO from <i>Boechera</i> shift gene expression from somatic to reproductive tissues in <i>Arabidopsis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Among candidate genes underlying the control components of apomixis, APOLLO is known for its strong linkage to apomeiosis in the genus Boechera . The gene has “apo-alleles”, which are characterized by a set of linked apomixis-specific polymorphisms, and “sex-alleles”. All apomictic□ Boechera genotypes are heterozygous for the apo/sex-alleles, while all sexual genotypes are homozygous for sex-alleles. In this study, native and synthetic APOLLO promoters were characterized by detecting the expression level of the β-glucuronidase (GUS) gene in Arabidopsis . Comparing various flower developmental stages in transgenic lines containing different constructs with 2 kb native transgenic lines revealed that changes to the APOLLO promoter causes shifts in tissue- and developmental-stage specificity of GUS expression. Importantly, several apomixis-specific polymorphisms in the 5’UTR change the timing and location of GUS activity from somatic to reproductive tissues. These synthetic data simulate a plausible evolutionary process whereby apomixis-specific gene activity can be achieved.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».