MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4386326510 · doi:10.3389/fmicb.2023.1210142

Prophylactic feeding of neomycin to Holstein calves alters gut microbiota, bile acid metabolism, and expression of genes involved in immunometabolic regulation

2023· article· en· W4386326510 sur OpenAlexaff
L.R. Cangiano, Ignacio R. Ipharraguerre, Le Luo Guan, L.N. Buss, Rocío Amorín, Miguel Chirivi, G. Andres Contreras, M.A. Steele

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIleumAdipose tissueBiologyNeomycinBile acidInternal medicineEndocrinologyLipid metabolismLactobacillusBifidobacteriumGastrointestinal tractLactobacillus acidophilusMicrobiologyBiochemistryMedicineProbioticAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to evaluate the effects of prophylactic neomycin administration on Holstein bull calves’ intestinal microbiota, bile acid (BA) metabolism, and transcript abundance of genes related to BA metabolism. A total of 36 calves were blocked by body weight and assigned to either non-medicated milk replacer (CTL), or neomycin for 14 days (ST) or 28 days (LT) in their milk replacer. At the end of the study, calves were euthanized to collect tissue and digesta samples from the gastrointestinal tract, liver, and adipose tissue for analysis of intestinal microbial diversity, bile acid concentration and profile in various body tissues, and gene expression related to bile acid, lipid, carbohydrate metabolism, and inflammation. Calves that received prophylactic administration of neomycin for 28 d (LT) had reduced species richness (chao1 index), and tended to have reduced phylogenetic diversity in the ileum tissue. The relative abundance of Lactobacillus, and Bifidobacterium in ileum and colon digesta were decreased in LT compared with CTL. Concentrations of primary, secondary, and total BA were increased by ST in ileal tissue. In plasma, ST and LT treatments had lower concentrations of secondary BA. Gene expression of the BA receptor FXR was increased in ileum and liver by LT compared to CTL. The expression of FXR and TGR5 in the liver was increased in the ST group compared with CTL, and in adipose tissue, 5 genes related to triglyceride, gluconeogenesis, and immune activation were differentially expressed between CTL and ST. In conclusion, we provide evidence that prophylactic administration of neomycin leads to aberrant changes in BA concentration and profile in different compartments of the enterohepatic system through a process that possibly entails antimicrobial disruption of key bacterial groups, which persists even after cessation of neomycin administration. Additionally, we uncovered an apparent link between dysregulated BA metabolism and changes in lipid metabolism and immune activation in adipose tissue and liver.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Microbiology→Même sujetGut microbiota and health→Travaux en français237 207→