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Enregistrement W4386348868 · doi:10.1002/ejic.202300288

Lanthanide‐FRET Molecular Beacons for microRNA Biosensing, Logic Operations, and Physical Unclonable Functions

2023· article· en· W4386348868 sur OpenAlexaff
Mariia Dekaliuk, Niko Hildebrandt

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Inorganic Chemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundInstitut National Du CancerPolska Akademia NaukSeoul National UniversityNational Research Foundation of KoreaInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheMinistry of Science and ICT, South KoreaEuropean Commission
Mots-clésFörster resonance energy transferMolecular beaconChemistryLanthanideBiosensorFluorescenceBioanalysisNanotechnologyDNAMaterials scienceBiochemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Time‐resolved or time‐gated (TG) biosensing and bioimaging with luminescent lanthanide probes and Förster resonance energy transfer (FRET) have significantly advanced bioanalytical chemistry. However, the development of lanthanide‐based molecular beacons (MBs) has been rather limited. Here, we designed DNA stem‐loop MB probes against two different microRNAs (miR‐21 and miR‐27b) using Tb and Eu FRET donors and quenching (BHQ2) and fluorescent (Cy3) FRET acceptors. Limits of detection down to 190 pM and duplexed miR‐21/miR‐27b quantification at low nanomolar concentrations with Tb‐BHQ2 and Eu‐BHQ2 TG‐FRET MBs demonstrated the versatility and high analytical performance of lanthanide‐based MBs. The particular donor‐acceptor distances in the Tb‐Cy3 MB resulted in inverted nucleic acid target concentration‐dependent TG PL intensities in short (e. g., 0 to 40 μs) and long (e. g., 0.1 to 2.1 ms) TG detection windows after pulsed excitation. We showed that this specific feature of our TG‐FRET MBs can be adapted to the design of molecular logic devices (NOR, OR, NAND, AND, XNOR, XOR, IMPLEMENT, and INHIBIT). Moreover, the almost unlimited choice of TG detection windows and the distinct spectral features of Tb and Cy3 over a broad visible spectral range could be exploited to devise biophotonic physical unclonable functions for highly secure authentication and identification. Our study manifests the versatility of lanthanides for advanced biophotonic applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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