Comparative omics reveals unanticipated metabolic rearrangements in a high-oil mutant of plastid acetyl-CoA carboxylase
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Heteromeric acetyl-CoA carboxylase (ACCase) catalyzes the ATP-dependent carboxylation of acetyl-CoA to produce malonyl-CoA, the committed step for de novo fatty acid synthesis. In plants, ACCase activity is controlled at multiple levels, including negative regulation by biotin attachment domain-containing (BADC) proteins, of which the badc1/3 double mutant leads to increased seed triacylglycerol accumulation. Unexpectedly, the Arabidopsis badc1/3 mutant also accumulates more protein. The metabolic consequences from both higher oil and protein was investigated in developing badc1/3 seed using global transcriptomics, translatomics, proteomics, and metabolomics. Changes include: reduced plastid pyruvate dehydrogenase; increased acetyl-CoA synthetase; increased storage and lipid-droplet packaging proteins; increased lipases; and increased β-oxidation fatty acid catabolism. We present a model of how Arabidopsis adapted to deregulated ACCase, limiting total oil accumulation, and altering flux through pathways of carbon accumulation that presents possible targets for future bioengineering of valuable seed storage reserves.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».