The Initial Hepatitis B Virus-Hepatocyte Genomic Integrations and Their Role in Hepatocellular Oncogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Hepatitis B virus (HBV) remains a dominant cause of hepatocellular carcinoma (HCC). Recently it was shown that HBV and woodchuck hepatitis virus (WHV) integrate into hepatocyte genome minutes after invasion. Retrotransposons and transposable sequences were frequent sites of the initial insertions suggesting a mechanism for spontaneous HBV DNA disperse throughout hepatocyte genome. Several somatic genes were also identified as early insertional targets in infected hepatocytes and woodchuck livers. Head-to-tail joints (HTJs) dominated amongst fusions indicating their creation by non-homologous-end-joining (NHEJ). Their formation coincided with robust oxidative damage of hepatocyte DNA. This was associated with activation of the poly(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1)-mediated dsDNA repair as reflected by augmented transcription of PARP1 and XRCC1, the PARP1 binding partner, OGG1, a responder to oxidative DNA damage, and by increased activity of NAD+, a marker of PARP1 activation, and HO1, an indicator of cell oxidative stress. The engagement of the PARP1-mediated NHEJ repair pathway explains HTJ format of the initial merges. The findings showed that HBV and WHV are immediate inducers of oxidative DNA damage, hijack dsDNA repair to integrate into hepatocyte genome and by this may initiate pro-oncogenic process. Tracking initial integrations may uncover early markers of HCC and help to explain HBV-associated oncogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».